由于结肠内的细菌对纤维素有酵解作用，所以可能增加肠道气体产生，出现胀气、排气增多等不良反应，一般常在数天后自然缓解。另外，由于纤维素化学结构中带有羟基或羧基等侧链基团，因此会与某些元素(特别是钙、铁、锌和磷等)结合，影响人体肠道内矿物质的代谢平衡。因此，在增加对食物纤维素摄取量的同时，应增加对钙、铁、锌和磷等元素的摄人量，以体内代谢的平衡。