绝大部分克隆病初都被误诊为急性阑尾炎，即使经验丰富的医师有时也难以进行鉴别，因为二者都可以见脐周或右下腹疼痛，右下腹有固定性压痛，白细胞计数升高等，故二者的鉴别要着眼于以下三点。

（1）详细了解病史和家族史：克隆病一般发病时间长，起病较缓，同一家族的发病率较高，而急性阑尾炎不具备这些特点。

（2）详细询问症状：克隆病往往有粪便呈糊状的轻度腹泻，不发热或有低热；另外，克隆病并发症较多，一定要详细询问。急性阑尾炎一般既往无腹泻、低热病史，也不会有很多并发症。

（3）术间详查：一旦辨之不清而进行手术，发现阑尾炎的病理改变与症状不符时，一定要慎重，详查回盲部且不要轻易切除阑尾，以免术后形成肠瘘。